e . Seroussi s Yosefi s Benjamini s Miyara s Bornelov f . Pitel Leroux, M。Morisson, l·安德森*
饱腹感的荷尔蒙瘦素具有关键作用的控制能量在哺乳动物体内平衡。瘦素的产生几乎完全由脂肪组织和信号量的脂肪存储主要是下丘脑,而且外围组织。
最近,我们确定了长期寻求瘦素(SEROUSSI et al ., 2016),在“鸡基因组的阴暗面”,意义极其GC-rich区域难以和装配序列。
禽流感瘦素的表达分析显示一个不同的模式与哺乳动物相比,令人惊讶的是,没有脂肪组织中的表达。然而,我们发现,瘦素和瘦素受体(LEPR)基因表达的组织与瘦素信号的响应在哺乳动物中,而theirexpression指着一个自分泌/旁分泌的内分泌作用方式。
因此,禽流感瘦素的作用可能与繁殖,控制压力反应和代谢,但以不同的方式比
哺乳动物,因为它不是脂肪组织的信号。成功后鸡瘦素的识别,实现其在RNA-seq数据而不是基因组装配,我们问其他失踪的鸡的基因可以确定使用RNA-seq方法。广泛RNA-seq分析内脏脂肪,下丘脑和垂体,紧随其后的是成绩单组装和生物信息学分析导致鸡191年写的小说《基因的识别(BORNELOV et al ., 2017),所有高GC含量(~ 70%)。这些包括肿瘤坏死因子(TNF,也称为TNF)和nephrin (NPHS1),长在鸡基因组中追求。有趣的是,25的小说基因映射到鸡基因组组装Galgal5在最近的基因组。
这种映射显示tabout 70%的基因被映射到鸡microchromosomes,已知GC-rich。同样比例的基因基因块的映射证明表明缺失基因基因簇的安排在其它脊椎动物不能显示他们进化的损失。
,这些发现表明,鸡其他缺失基因可能位于GC-rich鸡基因组的基因簇。小说中鸡的基因,我们发现5在脊椎动物基因属于瘦素同线性组:RBM28, SND1 LRRC4, FLNC。
我们使用这个标识映射鸡瘦素基因及其基因syntenic鸡染色体1 p (SEROUSSI et al ., 2017),因此提供最终的证据的正确识别鸡瘦素基因。
*RishonLeZion农业研究组织,Volcani中心,以色列
医学生物化学和微生物学称,乌普萨拉大学瑞典乌普萨拉
引用
BORNELOV, S。,美国YOSEFI大肠SEROUSSI k . PENDAVIS南卡罗来纳州博格斯,M . GRABHERR M。FRIEDMAN-EINAT, l·安德森,2017:对应Lovell et al。以前认为是evolutionarilylost鸡基因的识别。基因组医学杂志18:112。
SEROUSSI E。,y肉桂,s . YOSEFI o .配基,j。史密斯,n . RAFATI s BORNELOV L。安德森,m . FRIEDMAN-EINAT 2016:识别Long-SoughtLeptin的鸡、鸭:瘦素表达模式的高度GC-RichAvian适合自分泌/旁分泌而非内分泌功能。内分泌学157:737 - 751。SEROUSSI E。f . PITEL, s . LEROUX m . MORISSON s BORNELOV
s . MIYARA YOSEFI,洛杉矶COGBURN D.W.伯特,l·安德森·m·FRIEDMAN-EINAT 2017:映射的leptinand syntenic鸡染色体1 p基因。BMC Genet.18:77。
